С XVI по XIX век Испания организовывала свои американские владения в вице-королевства и генерал-капитанства в соответствии с их стратегическим и экономическим значением. Вице-королевство Новая Испания возникло после падения Теночтитлана в 1521 году, со столицей в Мехико; оно охватывало Северную и Центральную Америку, Антильские острова, части современной территории США и Филиппины; в 1821 году оно стало Республикой Мексика. После завоевания Куско в 1534 году было создано Вице-королевство Перу со столицей в Лиме, включавшее большую часть Южной Америки. Его длительный упадок завершился битвой при Аякучо в 1824 году и падением последнего испанского оплота на Чилоэ в 1826 году, тогда как в 1830-е годы укреплялись новые республики, такие как Боливия. В 1780–1781 годах восстание в Перу, начатое креолами, переросло в крупное восстание коренного населения под предводительством Тупака Амару.

Новая Бурбонская династия взошла на испанский престол в 1700 году с Филиппом V и провела политические, экономические и административные реформы в Испании и во всех её колониях. Вице-королевство Новая Гранада было создано в 1717 году со столицей в Сантафе де Богота, упразднено в 1723-м и восстановлено в 1739-м; оно включало Колумбию, Панаму, Венесуэлу и Эквадор. Движения за независимость начались в 1810 году, а в 1819 году была образована Великая Колумбия, которая затем распалась в 1830 году на Колумбию, Венесуэлу и Эквадор; Панама отделилась от Колумбии в 1903 году, а в 1977 году договор Торрихос–Картер предусматривал возврат канала Республике Колумбия. Вице-королевство Рио-де-ла-Плата, созданное в 1776 году Карлом III, включало территории, ныне входящие в состав Аргентины, Боливии, Уругвая, Парагвая, северной части Чили и южной части Бразилии. На протяжении XIX века эти вице-королевства добились независимости. Между XVI и XIX веками Испания также создала сеть генерал-капитанств — Санто-Доминго, Гватемала, Нуэва-Виская, Юкатан, Флорида, Пуэрто-Рико, Чили, Внутренние провинции и Венесуэла, последняя провозгласила независимость в 1811 году, — что отражало постепенную фрагментацию имперской власти.

Гуане занимали обширный регион на территории современной Колумбии, граничивший с яригийес, читареро, лачес, поимас и другими коренными народами. Хронисты, такие как Хуан де Кастельянос и Педро Симон, описывали их как отличных от других америндских популяций. Археологические данные из таких мест, как Меса-де-лос-Сантос, вместе со сканами и рентгеновскими снимками мумий гуане, указывают на формы черепа, воспринимавшиеся как «кавказоидные», часто изменённые путём преднамеренной деформации. С рождения головы младенцев сжимали между дощечками, перевязанными лентами, иногда с дополнительными боковыми элементами, что придавало черепу вытянутую или уплощённую форму, служившую признаком иерархии и отличавшую их от соседних народов.

Гуане выращивали хлопок, маис, бобы, тыквы, множество фруктов и в значительной степени полагались на рыбу, дополняя рацион дичью, такой как олени. Женщины особенно славились умением прясть хлопок и волокно сейбы, создавая высококачественные ткани, окрашенные индиго, кошенилью, шафраном и другими растительными пигментами и украшенные роликовыми «пинтадерас», которые придавали их тканям изысканную отделку. Они также обрабатывали фике и тростник для изготовления корзин и создавали эффектные предметы, такие как шапки из человеческих волос. Их керамика, часто окрашенная в красный цвет и украшенная налепными или процарапанными человеческими и животными фигурами, хранит геологическую память их территории. Погребальные практики включали естественную мумификацию в засушливом климате, захоронения в керамических сосудах и размещение тел в трещинах скал; красный был цветом траура. Наскальное искусство, созданное растительными пигментами на высоких стенах каньонов, вероятно, выражало ритуальный или символический язык. О музыкальных традициях свидетельствуют инструменты, такие как флейты, окарины, пан-флейты и маракасы. После завоевания гуане и другие группы были переселены в поселения, такие как Монкора (ныне Гуане, в Баричаре), а их язык сохранился лишь в нескольких географических названиях.

Техники деформации черепа
Колониальные хронисты отмечали преднамеренную деформацию черепа, практиковавшуюся в таких регионах, как Гуане и Кимбая. По словам Педро Симона, когда рождался ребёнок, его голову формовали «так, как хотели, чтобы она была», используя дощечки, помещённые на лоб и затылок, стянутые повязками. Иногда нижнюю доску наклоняли или добавляли дополнительные боковые дощечки, так что по мере роста костей черепа внутри этих узких форм они принимали желаемую форму.

Как правило, череп сплющивали спереди назад, почти устраняя лоб и увеличивая затылочную область; в других случаях заднюю часть головы укорачивали или удлиняли «в форме шапочки». Эти практики, начинавшиеся в раннем младенчестве и продолжавшиеся годами, создавали поразительные формы головы, наблюдаемые во многих андских скелетных останках, и были связаны со статусом и коллективной идентичностью.

15 августа 1805 года на римском Монте-Сакро Симон Боливар поклялся перед своим учителем Симоном Родригесом, что не успокоится, пока не разобьёт цепи испанского владычества в Америке. В июле 1810 года он отправился с дипломатической миссией в Лондон, чтобы заручиться поддержкой дела независимости. После падения Первой республики он написал «Манифест Картахены» (26 мая 1812 года), в котором проанализировал её ошибки. В 1813 году правительство Новой Гранады назначило его главнокомандующим патриотических сил; из Кукуты он начал Кампанию Нижней Магдалены, издал Декрет о войне насмерть и вступил в Каракас, где вскоре был провозглашён «Освободителем» — титул, который ему также присвоила Мерида. Победы при Лос-Орконесе и Лос-Тагуанесе контрастировали с поражениями, такими как Ла-Пуэрта, и тяготами Эмиграции Востока в 1814 году. В изгнании на Ямайке в 1815 году он добивался британской поддержки, прежде чем организовать экспедиции с Гаити (1816–1817), войти в Ангостуру, основать газету «El Correo del Orinoco» и закрепить Гуаяну как стратегическую базу.

15 февраля 1819 года Боливар созвал Конгресс в Ангостуре и произнёс свою знаменитую речь, а затем начал Освободительную кампанию Новой Гранады, завершившуюся победой патриотов при Бояке 7 августа. В том же году Конгресс провозгласил Республику Колумбия (Великую Колумбию), а в 1820 году Боливар и Морильо подписали договор о регламентации ведения войны. Победа при Карабобо (24 июня 1821 года) обеспечила независимость Венесуэлы, а Конституция Кукуты учредила Великую Колумбию. Последующие кампании принесли триумф при Пичинче (1822), встречу с Сан-Мартином в Гуаякиле и освобождение Кито. В Перу битвы при Хунине (6 августа 1824 года) и Аякучо (9 декабря 1824 года) окончательно закрепили поражение Испании. Боливар вошёл в Лиму, продвинулся в Верхнее Перу и руководил созданием Республики Боливия в 1825 году. Его континентальный проект достиг апогея на Панамском конгрессе 1826 года, венчая политическую и военную эпопею, стремившуюся объединить испанскую Америку в свободе.

Мумификация у гуане происходила естественным образом благодаря климатическим условиям, а не в результате преднамеренных ритуальных техник. Другие захоронения помещали в керамические сосуды или в геологические трещины каньона Чикамоча, где красный цвет использовался как траурный. Наскальное искусство встречается на высоких утёсах и защищённых скальных стенах в каньоне Чикамоча и на Меса-де-лос-Сантос; его создавали растительными пигментами, наносимыми прямо на камень. Эти идеограммы, вероятно, были частью ритуального или символического языка. Гуане также занимались музыкой, используя флейты из тростника или кости, керамические окарины, зампоньи и маракасы — образцы этих инструментов хранятся в музее Каса де Боливар. Их язык утрачен и сохранился лишь в нескольких географических названиях. Поселение Монкора, ныне коррехимьенто Гуане в муниципалитете Баричара, позднее стало местом переселения гуане и других групп, размещённых в колониальных резервациях (ресгуардо).

Мастера народа гуане превосходно владели ткачеством, создавая тонко сотканные ткани с едва заметными штампованными узорами, выполненными с помощью роликовых пинтадер. Музей Каса-де-Боливар в Букараманге хранит одну из самых значимых коллекций этих работ, включая редкий колпак, сотканный из человеческих волос — предмет, не имеющий аналогов среди коренных народов Колумбии. Они также изготавливали корзины и повседневные предметы из фики, тростника кастилья и других местных волокон. Наряду с мастерством в текстиле гуане развили заметные навыки в изготовлении оружия, производя луки, стрелы, пращи, дубинки, копья-маканы и топоры из заточенного кремнистого камня. Эти орудия обеспечивали как повседневное выживание, так и защиту общины.

Гуане выращивали хлопок, маис, бобы, тыквы и множество фруктов, дополняя свой рацион охотничьей добычей, такой как олени и фара, хотя основным источником пищи для них была рыба. Женщины были искусными пряхами хлопковых и сейбовых волокон, используя простые деревянные веретёна и создавая ткани заметной утончённости. Индиго давал синие оттенки, кошениль — пурпурный, шафран — жёлтый, а растение trompeto — киноварно‑красный тон; растение под названием «barba de piedra» давало особый красный цвет. Их ткани стали важным торговым товаром, который обменивали на соль с муисками, на керамику с читареро и ойбас, а также на раковины с карибскими народами.