1814年，总督何塞·米格尔·德·拉·卡列签署了由何塞·费利克斯·德·雷斯特雷波起草的奴隶解放法。不久之后，德尔·科拉尔因伤寒去世，几乎没有有能力的领导人来稳定该州。地方冲突和内部软弱加速了安蒂奥基亚的崩溃，以及在西班牙平定行动中的屈服。1818年，萨马诺任命卡洛斯·托尔拉上校为政治和军事总督，但在1819年爱国者在博亚卡获胜后，他从圣菲·德·安蒂奥基亚逃离。同年，一道王室敕令确认了安蒂奥基亚教区的设立，而时任军事总督的何塞·玛丽亚·科尔多瓦将军下令处决西班牙人、前财政官员何塞·玛丽亚·德尔·巴列。

1810年9月，安蒂奥基亚最后一任王室总督弗朗西斯科·德·阿亚拉宣誓就任最高统治委员会主席，并任职至1811年初。从当年1月起，安蒂奥基亚事实上拥有了自己的政府，尽管仍披着旧制度的外衣，并派出胡安·包蒂斯塔·德尔·科拉尔和何塞·曼努埃尔·雷斯特雷波等代表前往波哥大的制宪会议。此后不久，该省宣布其作为安蒂奥基亚联邦州的地区主权，于1812年在里奥内格罗通过宪法，并按照共和原则组织行政机构，同时仍倾向于强有力的中央权威。

1813年，西班牙准将胡安·萨马尼奥自波帕扬进军，对安蒂奥基亚构成威胁，并加剧了保皇派与爱国者之间的分裂。在举棋不定的立法机构之中，德尔·科拉尔动员起对独立的支持，使该州进入战时状态，并于1813年8月11日宣布安蒂奥基亚脱离西班牙。1814年，在总督何塞·米格尔·德·拉·卡列的领导下，省议会通过了由何塞·费利克斯·德·雷斯特雷波起草的渐进解放奴隶法，但德尔·科拉尔在同年去世，留下的有能力的领导人寥寥无几。地方纷争以及缺乏统一的领袖，使安蒂奥基亚在西班牙平定行动中相对容易地屈服。此后，萨马尼奥任命卡洛斯·托尔拉为政治与军事总督，但在1819年爱国者在博亚卡获胜后，他被迫逃离。同年，随着独立战争的胜利，时任安蒂奥基亚军事总督的何塞·玛丽亚·科尔多瓦将军下令处决前王室财政官员何塞·玛丽亚·德尔·巴列——这一事件象征着西班牙在该省权威的最终崩溃。