في سبتمبر 1810، أدّى آخر حاكم ملكي لأنتييوكيا، فرانسيسكو دي أيالا، اليمين رئيسًا للمجلس الأعلى للحكم، وظل في منصبه حتى أوائل عام 1811. ومنذ يناير من ذلك العام، أصبح لأنتييوكيا عمليًا حكومتها الخاصة، وإن كانت لا تزال متلفّعة بأشكال النظام القديم، وأرسلت مندوبين مثل خوان باوتيستا ديل كورال وخوسيه مانويل ريستريبو إلى المؤتمر التأسيسي في بوغوتا. وسرعان ما أعلنت المقاطعة سيادتها الإقليمية بوصفها الدولة الفيدرالية لأنتييوكيا، واعتمدت دستورًا في ريونيغرو عام 1812، ونظّمت إدارتها وفق مبادئ جمهورية، مع تفضيل واضح لسلطة مركزية قوية.

في عام 1813 تقدّم البريغادير الإسباني خوان سامانو من بوبايان، مهددًا أنتييوكيا ومفاقمًا الانقسامات بين الملكيين والوطنيين. وفي ظل هيئة تشريعية مترددة، حشد ديل كورال الدعم للاستقلال، ووضع الولاية في حالة تعبئة عسكرية، وفي 11 أغسطس 1813 أعلن انفصال أنتييوكيا عن إسبانيا. وفي عام 1814، في عهد الحاكم خوسيه ميغيل دي لا كايي، أقرت المقاطعة قانونًا للتحرير التدريجي من العبودية صاغه خوسيه فيليكس دي ريستريبو، لكن ديل كورال توفي في العام نفسه، تاركًا قلة من القادة الأكفاء. وقد أدت النزاعات المحلية وغياب شخصية موحِّدة إلى خضوع أنتييوكيا بسهولة نسبية خلال حملة pacificación الإسبانية. ولاحقًا عيّن سامانو كارلوس تولرا حاكمًا سياسيًا وعسكريًا، لكنه فرّ بعد انتصار الوطنيين في بوياكا عام 1819. وفي ذلك العام، عقب انتصارات الاستقلال، أمر الجنرال خوسيه ماريا كوردوفا، الذي أصبح حاكمًا عسكريًا لأنتييوكيا، بإعدام خوسيه ماريا ديل بايي، وهو موظف سابق في الخزانة الملكية — وهي حادثة رمزت إلى الانهيار النهائي للسلطة الإسبانية في المقاطعة.

في عام 1814، وقّع الحاكم خوسيه ميغيل دي لا كايي قانون تحرير الأشخاص المستعبَدين، الذي صاغه خوسيه فيليكس دي ريستريبو. بعد وقت قصير، توفي ديل كورال بحمى التيفوئيد، تاركًا قلة من القادة القادرين على استقرار الدولة. سرّعت النزاعات المحلية والضعف الداخلي من انهيار أنتيوكيا وخضوعها خلال فترة التهدئة الإسبانية. في عام 1818، عيّن سامانو العقيد كارلوس تولرا حاكمًا سياسيًا وعسكريًا، لكنه فرّ من سانتا في دي أنتيوكيا بعد انتصار الوطنيين في بوياكا عام 1819. في ذلك العام، أكّد مرسوم ملكي إنشاء أبرشية أنتيوكيا، وأمر الجنرال خوسيه ماريا كوردوفا، الذي أصبح حاكمًا عسكريًا، بإعدام الإسباني خوسيه ماريا ديل بايي، الموظف السابق في الخزانة.